חומצת גרעין נעולה, LNA

חומצות גרעין נעולות (LNAs) הן מחלקה של נגזרות נוקלאוטידים בעלות מבנה דו-מחזורי ייחודי. התכונה המבנית המולקולרית שלהם טמונה ביצירת מערכת דו-ציקלית קשיחה באמצעות גשר מתילן בין אטום החמצן 2'- ואטום הפחמן 4'- של טבעת הריבוז. שינוי מבני זה מקנה ל-LNA תכונות פיזיקוכימיות שונות באופן מובהק מאלה של DNA ו-RNA קונבנציונליים. מנקודת מבט של דינמיקה מולקולרית, הכנסת גשר המתילן נועלת את טבעת הריבוז הפורנוז הגמישה ביותר למבנה קבוע, ומפחיתה מאוד את החופש הסיבובי התוך מולקולרי. מאפיין מבני זה מביא ישירות לשלוש השפעות מפתח:

ראשית, מבנה טבעת הסוכר הקבוע משפר באופן משמעותי את הקשיחות המקומית של עמוד השדרה הפוספט, המקנה לאוליגונוקלאוטידים של LNA עמידות מצוינת לנוקלאזות.

שנית, נעילה קונפורמטיבית מאפשרת לבסיסי הגרעין לשמור על גיאומטריית זיווג קריק- האופטימלית של Watson, מה שמגביר באופן משמעותי את זיקת ההכלאה. מחקרים הראו ששינוי LNA בודד יכול להגביר את טמפרטורת ההיתוך (Tm) של הדופלקס אוליגונוקלאוטיד ב-2-8 מעלות, ושיפור היציבות התרמית הזה בולט במיוחד ביישומי אוליגונוקלאוטידים קצרים-.

לבסוף, המבנה הנוקשה גם מעניק ספציפיות רצף גבוהה יותר למולקולות LNA, ומאפשר להן להבחין באי-התאמות- של בסיס בודד בדיוק רב יותר.

למשל המוצרים הבאים:

מס' CAS:206055-79-0 LNA-A(Bz) פוספורמידיט

מס' CAS:206055-82-5 LNA-5mC(Bz) פוספורמידיט

מס' CAS:206055-75-6 LNA-T פוספורמידיט

מס' CAS:206055-77-8 LNA-G(iBu)-CE-Phosphoramidite

מס' CAS:709641-79-2 LNA-G(DMF)-Phosphoramidite